公证财产协议时，夫妻双方可以选择以下公证机构：
户籍所在地的公证机构：夫妻一方或双方的户籍所在地的公证机构通常有管辖权。
经常居住地的公证机构：如果夫妻一方或双方在某个地方连续居住了一定时间（具体时间要求可能因地区而异），该地可以被视为经常居住地，相应的公证机构也有管辖权。
行为地或者事实发生地的公证机构：例如财产所在地的公证机构，如果公证的财产协议与特定地点的财产相关。
双方协商一致选择的其他公证机构：在法律允许的范围内，夫妻双方可以协商选择双方都认可的任何合法的公证机构。
需要注意的是，不同地区的公证机构对于受理公证申请可能有具体的规定和要求，建议在选择公证机构之前先进行咨询。
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